Ihre Patentante ist Elke Clijsters, Kims Schwester, die ebenfalls Tennisspielerin war und als Juniorin 2002 Weltmeisterin im Doppel wurde, ihre Karriere wegen Rückenproblemen allerdings aufgeben musste. Im September 2013 und im Oktober 2016 wurde Kim Clijsters jeweils Mutter eines Jungen.
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